Permasalahan ini timbul ketika saya telah memperbarui VirtaulBox pada Fedora 24, setelah googling sana ini ternyata solusinya cukup sederhana: jalankan vboxconfig.
/sbin/vboxconfig
Saya pikir karena port USB laptop ini yang bermasalah, ternyata karena ada beberapa berkas yang harus dibuat symlink dan rebuildVirtualBoxkernelmodules. Semoga bermanfaat bagi Anda yang mengalami masalah yang sama.